Nizak stupanj moderniziranosti željeznice uključuje:
Prevladavaju jednotračne pruge.
Prevladavaju neelektrificirane pruge.
Prevladavaju pruge slabije kvalitete koje ne dopuštaju transport većim brzinama.

Procedure na granicama usporavaju i otežavaju promet:
Nizak nivo interoperabilnosti – potreba za promjenom lokomotiva na granici.
Duga vremena čekanja i procedure na granici.

Nedostaci su istaknuti u TER projektu za razvoj međunarodnog željezničkog transporta. Planovi za razvoj nizinske pruge Rijeka – Zagreb i modernizacija pruga na koridoru X, te približavanje Europskoj uniji upućuju na rješavanje navedenih nedostataka.